亳州经济开发区是1993年经国家批准设立的省级经济开发区，2005年规划面积确定为5.66平方公里；2013年7月经省政府批准与南部新区整合，现辖区面积56.66平方公里。辖区人口7.5万人。

　　一、高瞻远瞩，科学规划的示范区

　　亳州经济开发区分东区和南区 　　东区位于京九铁路以东，依偎涡河河湾，规划面积5.66平方公里，以开发旅游观光、休闲娱乐、度假、商贸市场、现代物流为主。

　　南区位于药都大道以南307省道以西，宋汤河以东,南二环以北，规划用地总面积51平方公里。规划结构确定为“一心、三组团、四轴、四带”。一“中心”：希夷大道和南一环交叉口为中心，集中发展商业金融、商务公寓、文化休闲等重要设施。“三组团”：西部工业组团、中部综合组团和东部综和组团。“四轴”：希夷大道、世纪大道、古井大道和南一环路城市发展轴。“四带”：凤尾沟、宋汤河、龙凤新河和京九铁路四大绿化景观带。

　　二、区位优越，交通便捷的物流区

　　亳州位于中原战略要地，素有“中州锁钥，南北通衢”之称，地处华东腹地、黄淮海南麓、苏鲁豫皖结合部，承东接西，贯南通北。亳州经济开发区位于城市的东部和南部，境内京九铁路，105国道、307省道穿境而过、毗邻济广、南洛高速，区内道路纵横交错，四通八达。涡河航线通江达海，直抵沪、杭。合肥、郑州、徐州、阜阳四大机场坐落周边，亳州支线已纳入国家“十二五”综合交通运输体系规划。

　　三、优势明显，特色鲜明的高新区

　　亳州是闻名遐迩的中华药都，中药产业已发展成中药材种植、加工、流通、科研和文化传播等比较完整的产业体系。亳州经济开发区工业区2012年被省政府批准为现代中医药产业园，园区规划面积11平方公里，重点发展中医药饮片、中药提取、中成药制造、中药保健品、中药日化、中药兽药等，打造现代中医药集群为特色的产业园区，该区将是我省唯一的集生产、中式孵化、科研、信息为一体的国内独具特色、国际具有影响的现代医药工业集中区，力争“十二五”期间实现“培育百亿元中药产业园区”的宏伟目标 。园区在发展中医药的同时，适度发展功能性食品、保健品、生物技术、电子、服装等产业。良好的投资环境，一流的基础设施，优惠的投资政策已吸纳康美药业、双鹤药业、天江药业、精华制药、修正药业、实权光电等90多家企业入驻园区。